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vector nti advance 11

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发表于 2024-12-6 23:35:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
软件标签:  vectornti   行业软件
vector nti 11.5是一款在生物行业中广泛运用的工具,为你带来最便捷的生物分析分析工,轻松的对各类生物元素进行最全面最细致的分析,同时能够得到点阵关系图,快速进行基因匹配等功能,快来绿色资源网下载吧!
vector nti 11官方介绍
vector nti advance在序列对比、蛋白质研究、基因分析等方面也是可以使用的,为生物学研究人士提供一个可以计算的实验平台。在生物数据分析上的使用是非常广泛的,其提供的四个分析模块可以针对dna、限制酶、引物分析、蛋白质等类型的生物数据进行详细模拟和演化分析,您可以将自己的实验数据加载到软件中,创建一个可以持续分析的实验模拟过程,在不同的实验阶段输入得到的数据,通过掌控数据参数的方式让分子不断进化,从而对未来的生物数据进行预测和判断分析;
vector nti 11软件特色
从alignx出口分子

在文本窗格中选定的分子可以出口到genbank、embl(genpept蛋白质)(swiss-prot蛋白质),或为原序列fasta文件。若要将分子导出到外部文件,请选择项目>导出分子,并在“文件保存”对话框中选择文件类型。

得分矩阵-- alignx

设计成对序列比对评估的所有算法都是基于将分数分配给对齐残基的系统,检测不同序列之间的相似性。众所周知,某些氨基酸在其他相关蛋白质中很容易被其他氨基酸取代,这可能是因为它们具有相似的理化性质。根据氨基酸被替换为原始残基的相似性,这些“替换”被分配在矩阵中显示的分数。在对齐分数上相同或相似的残留物比那些不太相似的残留物高

比对pcr分析报告

当搜索完成时,如果您在结果选项卡上检查了生成报告选项,则对齐pcr报告预览窗口显示分析结果。比对pcr分析报告对话框的外观和功能类似于多重pcr分析报告对话框。

关于点阵

点阵分析主要是比较两个序列来寻找所有可能的残基匹配的方法。该方法还可用于蛋白质和dna序列中的直接或反向重复序列。它可以预测rna中自我互补的区域,从而形成双链区或二级结构。

分析bioannotator

?

bioannotator是一套全面的蛋白质和核酸序列分析工具,超过五十种不同的预定义的蛋白表与特征映射和序列提供。bioannotator还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控:prosite,pfam,块和蛋白水解裂解。

通过web执行分析

vector nti使得它很容易把你的alignx数据直接到公共网站已经建立了一个分子的三维结构,比较它与其他分子,特定功能的搜索,或进行基因预测,等等。
vector nti advance 11功能介绍
分析genombench

genombench是vector nti提前的基因组项目的主力。genombench可以容纳一个碱基的基因组片段,可以检索从兼容的系统兼容的服务器上的数据,例如ucsc和ensembl。它提供了浏览和查询这些网站使用关键词,界面两侧标记,blat(ucsc数据库)或ssaha(的)。genombench还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控

对分子序列的操作

我们以一个dna序列为例,进行一系列的常规分析;最后将此dna序列翻译成氨基酸序列,并对此氨基酸序列进行各种分析。

对齐显示设置——consensus calculation tab

一致性序列是一个理论上有代表性的核苷酸序列,其中每个核苷酸代表在同一位点上在同一位点上经常看到的残基,或由其他标准选择。“对齐设置”对话框中的“一致性计算”选项卡指定如何以对齐方式计算对齐窗格中作为底部序列的一致序列。

以点击作为特征输出查询分子

当您导出查询显示为特征的分子打成。gff文件,使用点击功能gff文件命令导出查询分子保存。gff文件到外部位置(硬盘、软盘、网络等)。你可以打开一个。在一个vector nti分子视窗gff文件并将其保存到vector nti数据库,如果需要的话。。gff文件提供一个共享查询爆破方法打信息与其他vector nti用户分子格式。

模拟电泳

模拟电泳是指对dna片段进行酶切分析后,通过电脑模拟电泳过程,将酶切片段分离。该功能有利于评估电泳时间,便于验证实际电泳结果的好坏。



使用说明
图案设置

选中“图案”复选框,在“显示设置”对话框中激活“图案设置”按钮,打开控制图标显示的“图形设置”对话框。此对话框中可用的选项根据打开盒子的源分子类型而有所不同。

示设置功能

在显示设置对话框,检查个复选框,按框设置”按钮来指定如何开放阅读框orf显示打开设置对话框。

·检查嵌套框复选框查找嵌套orfs(具有相同的终止密码子,但不同的起始密码子,orf)

·在起始密码子和终止密码子字段,输入起始密码子和终止密码子为新观众的orfs。按默认的启动和停止按钮来设置起始密码子和终止密码子的传统价值观:起始密码子atg、gtg;终止密码子taa,tga,标签。

·在最小orf大小字段中,输入密码子中最小的orf大小。

工具管理器

要打开工具管理器,请单击工具>工具管理器。

有关使用工具管理器的信息,请按f1命令从该对话框打开联机帮助。

工具管理器是一个vector nti回顾描述目前注册工具或创建新的工具或链接工具和现有的工具进行现有业务信息辅助应用。




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